samtools view accepted_hits.bam >out.tab
FCD0EGUABXX:1:1106:18768:115447#GCTTAATG 16 sg0.contig00001 511 50 49M * 0 0 TCAAGCCGGGCGGCAACTACCCCTACCGCTTCAACGTGACGGACCAGGA BBBBBBB_VU^II[eXWWYYHee_bdefb[^edee_^cecacca`PZZ_ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A28 YT:Z:UU NH:i:1
FCD0EGUABXX:1:1106:18768:115447#GCTTAATG 16 sg0.contig00001 511 50 49M * 0 0 TCAAGCCGGGCGGCAACTACCCCTACCGCTTCAACGTGACGGACCAGGA BBBBBBB_VU^II[eXWWYYHee_bdefb[^edee_^cecacca`PZZ_ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A28 YT:Z:UU NH:i:1
FCD0EGUABXX:1:1105:15629:159393#GCTTAATG 0 sg0.contig00001 651 50 49M * 0 0 TACCCGTTCCCCAAGCCACACGGGGAGGAGACCGTCCTCCTCGGCGAGT Y^_cc_\\Qbaaadfhaee`eeY^cOefhhhhhh`__cee`b[dc]]_B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YT:Z:UU NH:i:1
FCD0EGUABXX:1:1202:20748:59260#GCTTAATG 0 sg0.contig00001 1092 50 49M * 0 0 CAGACCGTGGACGCGCTCATGGTCACGGGCGCCCCCGTCGGCCGCTACT Y^_cZcc`ecVeedfdefffe`edf`_e[[`fd`UN]FT]^UFHOOTT_ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YT:Z:UU NH:i:1
FCD0EGUABXX:1:1107:2050:156463#GCTTAATG 0 sg0.contig00001 1139 50 49M * 0 0 CTACATGGCGGCGTCCCCGTACGACAGCGCCATCCCGCAGGGGCCACCG _[_ee`ceeee`ecfghhg^_c_bfffhhggdecdbbaaaaaW^T^aaa AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YT:Z:UU NH:i:1
FCD0EGUABXX:1:1106:3312:28276#GCTTAATG 0 sg0.contig00001 1427 50 49M * 0 0 CACGACCGGGACCAGACTGCCCATCTTCTCGTCGAGCATGAACAACGCG ___eeeeeff`ggafcgaeghhfhfhhb`f`aaffgff_cffbgga^a[ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C31 YT:Z:UU NH:i:1
FCD0EGUABXX:1:1101:17602:42428#GCTTAATG 16 sg0.contig00001 1553 50 49M * 0 0 CTCCCCCGCCCAGCCGCCGGTTATCTTCGACTACACCGCCGACGCCAGC BBBBBBBBBBBBBa^]d_hed]_`eedeeaeaV_Wheeeeeccccc___ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T5A40 YT:Z:UU NH:i:1
--转自